לפענח תעלומה רפואית
בתוכנית המחלות הלא מאובחנות של NIH נעזרים בריצוף כדי לחפש הסבר גנטי למחלה.
איך השוואה בין בני משפחה עשויה לספק רמז?
תוכנית פסגה · שיעור 5 · מביולוגיה לגרפים
מה גילינו בחקר?
בתשובותיכם חזרו שלושה רעיונות: מידע תורשתי, קריאות של מקטעים וחיבור בעזרת חפיפות. נרכז אותם בשלוש שאלות, ונבדוק שאפשר להסביר כל רעיון במילים שלנו.
פתיחת השיעור · כ־10-12 דקות.
מה מקבלים במעבדה?
מתוך התשובות שלכם: DNA נושא מידע תורשתי; ריצוף קובע את סדר האותיות שלו.
DNA הוא מולקולה בתוך תאים. A, T, C, G מסמנות ארבעה בסיסים; הסדר שלהם הוא הרצף. במודל שלנו מקבלים קריאות של מקטעים, והאותיות בכל מקטע כבר ידועות.
ATGCA
אותן אותיות יכולות ליצור רצף אחר. קוראים משמאל לימין.
כשכל האותיות כבר כתובות על הכרטיסים - מה עדיין איננו יודעים?
מה רוצים לשחזר, ולמה זה שימושי?
דימוי שחזר בתשובות: פאזל או ספר קרוע. אנחנו רוצים להסיק רצף ארוך שמסביר את הקריאות, ולגלות מה נמצא ליד מה.
ATG + TGC → ATGC
בלשי מזון
ב־CDC משווים רצפי DNA של חיידקי ליסטריה מחולים וממזון, לצד מידע על מה שאנשים אכלו, כדי לסייע באיתור מקור להתפרצות.
איך מקרים בערים שונות יכולים להוביל לאותו מוצר?
למה קשה לחבר?
מה עלה בתשובות: חפיפות עוזרות לחבר; חזרות ושגיאות עלולות לבלבל. גם מידע חסר עלול להשאיר פערים.
מוצאים חפיפה
ATG + TGC → ATGC
סוף המקטע הראשון זהה להתחלת השני.
אבל מה בוחרים?
ATG → TGC ?
ATG → TGA ?
שניהם מתאימים עכשיו. האם שניהם יאפשרו להשלים את כל המשימה?
השלימו בעל פה: מקבלים ___; רוצים לדעת ___; קשה כי ___.